Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité – ISYEB
UMR 7205 – Muséum national d’Histoire naturelle
Biologie de l’évolution
Etude de la diversification phénotypique et taxonomique : écologie évolutive, génétique/génomique des populations, morphologie fonctionnelle, patrons spatio-temporels de diversification et de disparité, tests de scénarios évolutifs à large échelle (radiation adaptative, biais biogéographiques de diversité, spéciation allopatrique, convergences…)
Diversité, histoire évolutive et interactions entre les Embryophytes (plantes terrestres) et des Eumycètes (champignons « vrais ») : parasitisme, endophytisme, mycorhizes… Interactions entre organismes et milieux, évolution adaptative, spéciation…
Diversification (Plio-Pleistocène) d’espèces de petits vertébrés terrestres non modèles à une échelle péri-spécifique : approche de systématique intégrative basée sur les collections et combinant des données moléculaires (phylogénie, phylogéographie, génétique des populations), cytogénétiques, morphométriques et écologiques
Terre vivante
Analyse phylogénétique des caractères phénotypiques complexes, organisation et gestion des connaissances sur la biodiversité (classification et nomenclature, taxonomie, bases de données), développement de procédures d’échantillonnage (interprétation des données fossiles, méta-approches acoustiques) ; exploration, caractérisation et mise en ordre phylogénétique de la biodiversité, étude des homologies des structures moléculaires ou anatomiques
Biologie de la mangrove : interactions bactéries thioautotrophes-invertébrés dans le cadre des modèles chimiosynthétiques, organisation et fonctionnement de la mangrove en relation avec ses espèces sédentaires, analyse du développement embryonnaire et larvaire d’espèces endogènes
Systématique : taxonomie intégrative, documentation de diversité des espèces et de l’histoire évolutive des taxons, étude des mécanismes à l’origine de la diversité spécifique, synthèse des approches descriptives et évolutives de la systématique
Biologie du développement
Développement, adaptation et évolution des structures morpho-anatomiques des plantes terrestres, à différentes échelles taxinomiques et en réponse à des contraintes de l’environnement : morpho-anatomie, culture in vitro, imagerie, morphométrie, bioinformatique…
Equipe Morpho-Anatomie et Développement des Plantes
Génétique, génomique et ARN
- Mécanismes de l’évolution : métagénomique évolutive des communautés microbiennes des archipels du Pacifique sud, synthèse des ARN pré-biotiques et des briques élémentaires à l’origine de la vie
- Propriétés informationnelles et catalytiques des acides ribonucléiques, synthèse de fragments d’ARN en conditions hydrothermales, plasticité et modularité des viroïdes MCM
- Structuration de la variabilité génétique et phénotypique : identification de gènes candidats à la différentiation et à la spéciation, lien entre la position des gènes candidats et l’architecture du génome…
Microbiologie – Contaminants, écosystèmes et santé
- Evolution microbienne : épidémiologie moléculaire, dispersion, démogénétique et résistance aux antibiotiques TW, métagénomique évolutive des communautés microbiennes des archipels du Pacifique sud
- Modifications phénotypiques face aux changement environnementaux, anthropisation, écologie urbaine
Equipe Phylogénomique, phylodynamique et interactions hôtes-pathogènes
Interfaces : mathématiques, sciences du numérique – sciences du système Terre et de l’environnement
- Atelier de bio-informatique pour l’évolution moléculaire, la génomique, la modélisation…
- Modélisation des connaissances descriptives en systématique (observations morpho-anatomiques et hypothèses d’homologie/caractères), développement de logiciels pour la taxonomie, la phylogénétique et la biogéographie